sábado, 3 de abril de 2010

Representación de Aminoácidos


Un aminoácido, como su nombre indica, es una molécula orgánica con un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilico (-COOH; ácido). Los aminoácidos más frecuentes y de mayor interés son aquellos que forman parte de las proteínas. Dos aminoácidos se combinan en una reacción de condensación que libera agua formando un enlace peptídico. Estos dos "residuos" aminoacídicos forman un dipéptido. Si se une un tercer aminoácido se forma un tripéptido y así, sucesivamente, para formar un polipéptido. Esta reacción ocurre de manera natural en los ribosomas, tanto los que están libres en el citosol como los asociados al retículo endoplasmático.... más en Wikipedia
Os he comentado en otra entrada que he trabajado en un visor de proteinas hace varios años. Como parte de ese software, hubo que desarrollar una serie de iconos que representaran los elementos básicos constituyentes de las proteínas, los aminoácidos.

La orientación gráfica de estos trabajos es el aspecto que siempre he querido destacar y, en este caso, os muestro los modelos de representación esquemática desarrollados para identificar los aminoácidos que se encuentran en las proteínas. Cada icono va acompañado de su nombre corto y un enlace a información complementaria.

Se encuentran ordenados alfabéticamente, y no agrupados por propiedades electro-químicas. Todos comparten el grupo amino formado por dos átomos de Carbono(Negro) y uno de Nitrógeno (azul).

Los átomos de Hidrógeno se han situado a modo de "brazos" para simplificar el modelo, y aportar el concepto de puntos de unión para posible puentes de Hidrógeno.




Ala


Arg

Asn

Asp
Cys
Gln

Glu
Gly
His

Hyl
Ile
Leu
Lys
Met
Phe
Pro
Ser
Thr
Trp
Tyr
Val




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  • Libro recomendado: Estructura de proteínas. Carlos Gómez-Moreno Calera y Javier Sancho Sanz (Coords.) Ariel Ciencia. ISBN 84-344-8061-6 1ªedición Sep 2003

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Los enlaces que completan las ilustraciones son informaciones y opiniones de sus autores, muchas veces diferentes e incluso manifiestamente opuestas, buscando un contraste de visiones.

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